Celera Report

/organism=Mus musculus
/order=60 /ga_uid=181000113608708 /len=71878572
/scaffold_class=ge10k
Length = 500000

Score = 615 bits (310), Expect = e-173
Identities = 310/310 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 328 agtgggagatttttcacggtcaagctcccagttgctcttgatcctgggtccaagatctcg 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323360 agtgggagatttttcacggtcaagctcccagttgctcttgatcctgggtccaagatctcg 323419


Query: 388 gtcgttgtggaaactgtctacacccatgtgcttcatccgtatccgactcagataactcag 447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323420 gtcgttgtggaaactgtctacacccatgtgcttcatccgtatccgactcagataactcag 323479


Query: 448 tcagagaaacagttcgtcgtgtttgagggcaaccattatttctactctccctatccaaca 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323480 tcagagaaacagttcgtcgtgtttgagggcaaccattatttctactctccctatccaaca 323539


Query: 508 aagacccagaccatgcgagtgaaactggcgtcccgaaatgtggaaagctataccaagctg 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323540 aagacccagaccatgcgagtgaaactggcgtcccgaaatgtggaaagctataccaagctg 323599


Query: 568 gggaacccctcgagatctgaggacgtccttgattatgggccttttaaagacatccctgcc 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323600 gggaacccctcgagatctgaggacgtccttgattatgggccttttaaagacatccctgcc 323659


Query: 628 tacagtcagg 637
||||||||||
Sbjct: 323660 tacagtcagg 323669

 

Score = 523 bits (264), Expect = e-145
Identities = 264/264 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 1 atggagtcgccggtcgccttgctgttgctgctgctgctatgtctcggggccttggccccg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317894 atggagtcgccggtcgccttgctgttgctgctgctgctatgtctcggggccttggccccg 317953


Query: 61 acgcccggcagcgcctcctcggaggctccgccgctggtcaacgaggacgtgaagcgcacg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317954 acgcccggcagcgcctcctcggaggctccgccgctggtcaacgaggacgtgaagcgcacg 318013


Query: 121 gtggacctgagcagccacctagccaaggtgacggctgaggtggtcctggtacacccgggc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318014 gtggacctgagcagccacctagccaaggtgacggctgaggtggtcctggtacacccgggc 318073


Query: 181 ggcggctccacatcacgagccagctctttcgttctggccctggagccagaactggagtcg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318074 ggcggctccacatcacgagccagctctttcgttctggccctggagccagaactggagtcg 318133


Query: 241 cggcttgcgcacctaggcgtgcag 264
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318134 cggcttgcgcacctaggcgtgcag 318157

 

Score = 505 bits (255), Expect = e-140
Identities = 255/255 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 1397 aggatccagctgcagaagccaggatgaaagtggcctgtatcacagagcaggtcttaaccc 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335456 aggatccagctgcagaagccaggatgaaagtggcctgtatcacagagcaggtcttaaccc 335515


Query: 1457 tggtcaacaagaggctgggcctctaccgtcactttgatgagactgtcaatagatacaagc 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335516 tggtcaacaagaggctgggcctctaccgtcactttgatgagactgtcaatagatacaagc 335575


Query: 1517 agtcccgggatatctctaccctcaacagtggcaagaagagcctagagacagagcacaagg 1576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335576 agtcccgggatatctctaccctcaacagtggcaagaagagcctagagacagagcacaagg 335635


Query: 1577 ctgtgaccagcgagattgctgtactgcagtctcggctgaagacggagggctcagacctgt 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335636 ctgtgaccagcgagattgctgtactgcagtctcggctgaagacggagggctcagacctgt 335695


Query: 1637 gtgacagggtgagtg 1651
|||||||||||||||
Sbjct: 335696 gtgacagggtgagtg 335710

 

Score = 412 bits (208), Expect = e-112
Identities = 211/212 (99%)
Strand = Plus / Plus


Query: 635 aggacactttcaaagtacattacgagaacaatagccctttcctgaccatcaccagtatga 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327157 aggacactttcaaagtacattacgagaacaatagccctttcctgaccatcaccagtatga 327216


Query: 695 cccgggtcatcgaggtatctcactggggcattattgctgtggaagagaacgtggacttga 754
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327217 cccgggtcatcgaggtatctcactggggcaatattgctgtggaagagaacgtggacttga 327276


Query: 755 agcacacgggcgcagtgctgaaggggcctttctcccgctacgattaccagaggcagcctg 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327277 agcacacgggcgcagtgctgaaggggcctttctcccgctacgattaccagaggcagcctg 327336


Query: 815 acagtgggatctcctccattcgttcttttaag 846
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327337 acagtgggatctcctccattcgttcttttaag 327368

 

Score = 394 bits (199), Expect = e-107
Identities = 199/199 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 845 agaccatccttcctgctgccgcccaggatgtctattaccgggatgagattggtaatgttt 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328894 agaccatccttcctgctgccgcccaggatgtctattaccgggatgagattggtaatgttt 328953


Query: 905 ccaccagccacctccttatcttggatgactctgtggaaatggaaatccggcctcgatttc 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328954 ccaccagccacctccttatcttggatgactctgtggaaatggaaatccggcctcgatttc 329013


Query: 965 ctctctttggagggtggaagacacactacatcgttggttacaacctcccaagctatgaat 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 329014 ctctctttggagggtggaagacacactacatcgttggttacaacctcccaagctatgaat 329073


Query: 1025 acctctataatctgggtga 1043
|||||||||||||||||||
Sbjct: 329074 acctctataatctgggtga 329092

 

Score = 365 bits (184), Expect = 6e-98
Identities = 184/184 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 1644 ggtgagtgagatgcagaagctggacgcccaggtcaaggagctggtcctgaagtcggcggt 1703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336847 ggtgagtgagatgcagaagctggacgcccaggtcaaggagctggtcctgaagtcggcggt 336906


Query: 1704 agaagcagagaggctggtggctggcaagctcaagaaggatacgtacctggaaaacgagaa 1763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336907 agaagcagagaggctggtggctggcaagctcaagaaggatacgtacctggaaaacgagaa 336966


Query: 1764 gctcagctcaggaaaacgccaggagctggtcaccaagatcgaccacatcctggatgctct 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336967 gctcagctcaggaaaacgccaggagctggtcaccaagatcgaccacatcctggatgctct 337026


Query: 1824 gtag 1827
||||
Sbjct: 337027 gtag 337030

 

Score = 281 bits (142), Expect = 7e-73
Identities = 142/142 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 1140 gaacatccaggtggacagtccctacgatatcagccgggccccagacgagctgcattatac 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334112 gaacatccaggtggacagtccctacgatatcagccgggccccagacgagctgcattatac 334171


Query: 1200 ctacctagacacgttcggccgcccggtgattgtggcttacaagaagaatctcgtcgagca 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334172 ctacctagacacgttcggccgcccggtgattgtggcttacaagaagaatctcgtcgagca 334231


Query: 1260 acacattcaggacattgtggtg 1281
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334232 acacattcaggacattgtggtg 334253

 

Score = 242 bits (122), Expect = 6e-61
Identities = 122/122 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 1278 ggtgcactacacgttcaacaaggttctcatgctgcaggagccgctgctggtcgtggccgc 1337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334344 ggtgcactacacgttcaacaaggttctcatgctgcaggagccgctgctggtcgtggccgc 334403


Query: 1338 cttctacatcctgttcttcaccgtcatcatctacgtccgtctggacttttccatcaccaa 1397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334404 cttctacatcctgttcttcaccgtcatcatctacgtccgtctggacttttccatcaccaa 334463


Query: 1398 gg 1399
||
Sbjct: 334464 gg 334465

 

Score = 202 bits (102), Expect = 5e-49
Identities = 102/102 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 1039 ggtgaccagtatgcactgaagatgcggtttgtagaccacgtgtttgatgagcaagtgata 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 332756 ggtgaccagtatgcactgaagatgcggtttgtagaccacgtgtttgatgagcaagtgata 332815


Query: 1099 gattctctgacagtgaagatcatcttgcccgagggagccaag 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 332816 gattctctgacagtgaagatcatcttgcccgagggagccaag 332857

 

Score = 133 bits (67), Expect = 4e-28
Identities = 67/67 (100%)
Strand = Plus / Plus


Query: 263 agataaagggagaagatgaggaagacaacaacctagaagtacgagaaaccaaaattaaag 322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321711 agataaagggagaagatgaggaagacaacaacctagaagtacgagaaaccaaaattaaag 321770


Query: 323 ggaaaag 329
|||||||
Sbjct: 321771 ggaaaag 321777